Review Computational Methods for SNPs and Haplotype Inference

vietanh823

New member
Computational Methods for SNPs and Haplotype Inference

[Nhận Ngay Quà Tặng Đặc Biệt Khi Đặt Mua Ngay!]: (https://shorten.asia/FTQKt8wM)
### Phương pháp tính toán cho SNPS và suy luận haplotype

** Hashtags: ** #SNPs #Haplotype #inference

Đa hình đơn nucleotide (SNPs) là các biến thể di truyền xảy ra khi một nucleotide duy nhất trong trình tự DNA khác với trình tự tham chiếu.SNP là phổ biến trong bộ gen của con người, với trung bình một SNP xảy ra mỗi 1.000 cặp cơ sở.SNP có thể được sử dụng để nghiên cứu biến thể di truyền và để xác định các gen có liên quan đến các bệnh.

Haplotypes là các nhóm SNP được kế thừa cùng nhau.Haplotypes có thể được sử dụng để theo dõi sự di truyền của gen và để xác định các rối loạn di truyền.

Có một số phương pháp tính toán có thể được sử dụng để xác định SNP và haplotypes.Những phương pháp này bao gồm:

*** Sanger giải trình tự: ** Trình tự Sanger là một phương pháp giải trình tự DNA sử dụng phản ứng kết thúc chuỗi dideoxynucleotide để tạo ra một chuỗi các đoạn DNA.SNP có thể được xác định bằng cách so sánh trình tự của các đoạn DNA với chuỗi tham chiếu.
*** Trình tự thế hệ tiếp theo: ** Trình tự thế hệ tiếp theo (NGS) là một phương pháp giải trình tự DNA sử dụng các công nghệ giải trình tự thông lượng cao để tạo ra một số lượng lớn các chuỗi DNA.SNP có thể được xác định bằng cách so sánh các chuỗi của các đoạn DNA với chuỗi tham chiếu.
*** Kiểu gen dựa trên mảng: ** Kiểu gen dựa trên mảng là một phương pháp kiểu gen sử dụng microarrays cho SNP kiểu gen.SNP có thể được xác định bằng cách lai các mẫu DNA thành microarray và sau đó phát hiện các tín hiệu lai.

Việc lựa chọn phương pháp xác định SNP và haplotypes phụ thuộc vào số lượng SNP cần được xác định, mức độ chính xác mong muốn và ngân sách.

### Người giới thiệu

* [Viện nghiên cứu bộ gen người quốc gia (NHGRI)] (National Human Genome Research Institute Home | NHGRI)
* [Dự án bộ gen người] (The Human Genome Project)
* [Đa hình đơn nucleotide (SNP)] (Single-nucleotide polymorphism - Wikipedia)
* [Haplotype] (Haplotype - Wikipedia)
* [Sanger Sequencing] (Sanger - Wikipedia
* [Trình tự thế hệ tiếp theo (NGS)] (https://en.wikipedia.org/wiki/Next-Generation_Skencing)
* [Kiểu gen dựa trên mảng] (Array - Wikipedia dựa trên cơ bản_genotyping)
=======================================
[Nhận Ngay Quà Tặng Đặc Biệt Khi Đặt Mua Ngay!]: (https://shorten.asia/FTQKt8wM)
=======================================
### Computational Methods for SNPs and Haplotype Inference

**Hashtags:** #SNPs #Haplotype #inference

Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) are genetic variations that occur when a single nucleotide in the DNA sequence is different from the reference sequence. SNPs are common in the human genome, with an average of one SNP occurring every 1,000 base pairs. SNPs can be used to study genetic variation and to identify genes that are associated with diseases.

Haplotypes are groups of SNPs that are inherited together. Haplotypes can be used to track the inheritance of genes and to identify genetic disorders.

There are a number of computational methods that can be used to identify SNPs and haplotypes. These methods include:

* **Sanger sequencing:** Sanger sequencing is a method of DNA sequencing that uses a dideoxynucleotide chain-termination reaction to generate a sequence of DNA fragments. SNPs can be identified by comparing the sequence of the DNA fragments to the reference sequence.
* **Next-generation sequencing:** Next-generation sequencing (NGS) is a method of DNA sequencing that uses high-throughput sequencing technologies to generate a large number of DNA sequences. SNPs can be identified by comparing the sequences of the DNA fragments to the reference sequence.
* **Array-based genotyping:** Array-based genotyping is a method of genotyping that uses microarrays to genotype SNPs. SNPs can be identified by hybridizing the DNA samples to the microarray and then detecting the hybridization signals.

The choice of method for identifying SNPs and haplotypes depends on the number of SNPs that need to be identified, the desired level of accuracy, and the budget.

### References

* [National Human Genome Research Institute (NHGRI)](https://www.genome.gov/)
* [Human Genome Project](https://www.genome.gov/human-genome-project/)
* [Single-nucleotide polymorphism (SNP)](https://en.wikipedia.org/wiki/Single-nucleotide_polymorphism)
* [Haplotype](https://en.wikipedia.org/wiki/Haplotype)
* [Sanger sequencing](https://en.wikipedia.org/wiki/Sanger_sequencing)
* [Next-generation sequencing (NGS)](https://en.wikipedia.org/wiki/Next-generation_sequencing)
* [Array-based genotyping](https://en.wikipedia.org/wiki/Array-based_genotyping)
=======================================
[Sản phẩm mới nhất vừa ra mắt, nhanh tay sở hữu ngay! Theo đánh giá của khách hàng, sản phẩm này mang đến trải nghiệm tuyệt vời, đáng đồng tiền bát gạo.]: (https://shorten.asia/FTQKt8wM)
 
Join Telegram ToolsKiemTrieuDoGroup
Back
Top