goldenduck746
New member
[TIẾNG VIỆT]:
## Hướng dẫn của Amazon OMIC: Hướng dẫn từng bước
Amazon OMIC là một nền tảng dựa trên đám mây cung cấp một bộ công cụ để phân tích bộ gen.Nó cung cấp một loạt các tính năng, bao gồm lưu trữ dữ liệu, xử lý, phân tích và trực quan hóa.Hướng dẫn này sẽ hướng dẫn bạn qua quá trình sử dụng Amazon OMIC để thực hiện phân tích bộ gen cơ bản.
### Điều kiện tiên quyết
Để làm theo hướng dẫn này, bạn sẽ cần những điều sau đây:
* Một sự hiểu biết cơ bản về bộ gen
* Đăng ký vào Amazon Web Services (AWS)
* Amazon Omic Cli
* [Tài liệu OMIC Amazon] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/)
### Bắt đầu
Bước đầu tiên là tạo ra một dự án Amazon OMIC mới.Để làm điều này, hãy đăng nhập vào bảng điều khiển quản lý AWS và truy cập menu ** Dịch vụ **.Nhấp vào ** Genomics ** và sau đó nhấp vào ** các dự án **.Nhấp vào ** Tạo dự án ** và nhập tên cho dự án của bạn.
### Tải lên dữ liệu
Bước tiếp theo là tải dữ liệu bộ gen của bạn lên Amazon OMIC.Bạn có thể làm điều này bằng cách sử dụng Amazon OMIC CLI hoặc bảng điều khiển Amazon S3.Để sử dụng CLI, hãy chạy lệnh sau:
`` `
Tải lên OMIC--Bucket <-Buck-NAME>--Path <Path-to-data>
`` `
Trong đó `<Sbuck-name>` là tên của nhóm mà bạn muốn lưu trữ dữ liệu của mình và `<sath-to-data>` là đường dẫn đến dữ liệu trên máy tính cục bộ của bạn.
Để sử dụng bảng điều khiển S3, hãy truy cập [Bảng điều khiển Amazon S3] (https://s3.console.aws.amazon.com/) và tải dữ liệu của bạn lên thùng mà bạn đã tạo trong bước trước.
### Chạy phân tích
Khi bạn đã tải lên dữ liệu của mình, bạn có thể chạy một phân tích.Để làm điều này, bạn sẽ cần tạo một tệp cấu hình phân tích.Tệp này sẽ chỉ định loại phân tích mà bạn muốn chạy và các tham số cho phân tích.Bạn có thể tìm thêm thông tin về các tệp cấu hình phân tích trong [tài liệu Amazon OMIC] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/analysis-configuration-files.html).
Khi bạn đã tạo một tệp cấu hình phân tích, bạn có thể chạy phân tích bằng cách sử dụng Amazon OMIC CLI.Để thực hiện việc này, hãy chạy lệnh sau:
`` `
OMIC RUN--Config <Path-to-Phân tích-Configuration-File>
`` `
Amazon OMIC CLI sẽ chạy phân tích và đưa ra kết quả vào bảng điều khiển.
### Trực quan hóa kết quả
Kết quả phân tích của bạn có thể được hiển thị bằng giao diện web Amazon OMIC.Để làm điều này, hãy truy cập [Giao diện web Amazon OMIC] (https://omics.console.aws.amazon.com/) và nhấp vào tab ** **.Nhấp vào tên của dự án của bạn và sau đó nhấp vào tab ** Phân tích **.Bạn sẽ thấy một danh sách tất cả các phân tích đã được chạy trong dự án của bạn.Nhấp vào tên của phân tích mà bạn muốn trực quan hóa và sau đó nhấp vào tab ** trực quan hóa **.Bạn sẽ thấy một danh sách tất cả các trực quan đã được tạo ra để phân tích.Nhấp vào tên của trực quan mà bạn muốn xem.
### Phần kết luận
Hướng dẫn này đã cung cấp cho bạn một hướng dẫn từng bước để sử dụng Amazon OMIC để thực hiện phân tích bộ gen cơ bản.Để biết thêm thông tin, vui lòng tham khảo [tài liệu Amazon OMIC] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/).
### hashtags
* #Genomics
* #điện toán đám mây
* #aws
* #Bioinformatics
* #khoa học dữ liệu
[ENGLISH]:
## Amazon Omic Tutorial: A Step-by-Step Guide
Amazon Omic is a cloud-based platform that provides a suite of tools for genomic analysis. It offers a variety of features, including data storage, processing, analysis, and visualization. This tutorial will walk you through the process of using Amazon Omic to perform a basic genomic analysis.
### Prerequisites
To follow this tutorial, you will need the following:
* A basic understanding of genomics
* A subscription to Amazon Web Services (AWS)
* The Amazon Omic CLI
* The [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/)
### Getting Started
The first step is to create a new Amazon Omic project. To do this, log in to the AWS Management Console and go to the **Services** menu. Click on **Genomics** and then click on **Projects**. Click **Create Project** and enter a name for your project.
### Uploading Data
The next step is to upload your genomic data to Amazon Omic. You can do this by using the Amazon Omic CLI or the Amazon S3 console. To use the CLI, run the following command:
```
omic upload --bucket <bucket-name> --path <path-to-data>
```
Where `<bucket-name>` is the name of the bucket where you want to store your data and `<path-to-data>` is the path to the data on your local computer.
To use the S3 console, go to the [Amazon S3 console](https://s3.console.aws.amazon.com/) and upload your data to the bucket that you created in the previous step.
### Running an Analysis
Once you have uploaded your data, you can run an analysis. To do this, you will need to create an analysis configuration file. This file will specify the type of analysis that you want to run and the parameters for the analysis. You can find more information about analysis configuration files in the [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/analysis-configuration-files.html).
Once you have created an analysis configuration file, you can run the analysis by using the Amazon Omic CLI. To do this, run the following command:
```
omic run --config <path-to-analysis-configuration-file>
```
The Amazon Omic CLI will run the analysis and output the results to the console.
### Visualizing the Results
The results of your analysis can be visualized using the Amazon Omic web interface. To do this, go to the [Amazon Omic web interface](https://omics.console.aws.amazon.com/) and click on the **Projects** tab. Click on the name of your project and then click on the **Analysis** tab. You will see a list of all of the analyses that have been run in your project. Click on the name of the analysis that you want to visualize and then click on the **Visualizations** tab. You will see a list of all of the visualizations that have been created for the analysis. Click on the name of the visualization that you want to view.
### Conclusion
This tutorial has provided you with a step-by-step guide to using Amazon Omic to perform a basic genomic analysis. For more information, please refer to the [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/).
### Hashtags
* #Genomics
* #cloud-computing
* #aws
* #Bioinformatics
* #data-science
## Hướng dẫn của Amazon OMIC: Hướng dẫn từng bước
Amazon OMIC là một nền tảng dựa trên đám mây cung cấp một bộ công cụ để phân tích bộ gen.Nó cung cấp một loạt các tính năng, bao gồm lưu trữ dữ liệu, xử lý, phân tích và trực quan hóa.Hướng dẫn này sẽ hướng dẫn bạn qua quá trình sử dụng Amazon OMIC để thực hiện phân tích bộ gen cơ bản.
### Điều kiện tiên quyết
Để làm theo hướng dẫn này, bạn sẽ cần những điều sau đây:
* Một sự hiểu biết cơ bản về bộ gen
* Đăng ký vào Amazon Web Services (AWS)
* Amazon Omic Cli
* [Tài liệu OMIC Amazon] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/)
### Bắt đầu
Bước đầu tiên là tạo ra một dự án Amazon OMIC mới.Để làm điều này, hãy đăng nhập vào bảng điều khiển quản lý AWS và truy cập menu ** Dịch vụ **.Nhấp vào ** Genomics ** và sau đó nhấp vào ** các dự án **.Nhấp vào ** Tạo dự án ** và nhập tên cho dự án của bạn.
### Tải lên dữ liệu
Bước tiếp theo là tải dữ liệu bộ gen của bạn lên Amazon OMIC.Bạn có thể làm điều này bằng cách sử dụng Amazon OMIC CLI hoặc bảng điều khiển Amazon S3.Để sử dụng CLI, hãy chạy lệnh sau:
`` `
Tải lên OMIC--Bucket <-Buck-NAME>--Path <Path-to-data>
`` `
Trong đó `<Sbuck-name>` là tên của nhóm mà bạn muốn lưu trữ dữ liệu của mình và `<sath-to-data>` là đường dẫn đến dữ liệu trên máy tính cục bộ của bạn.
Để sử dụng bảng điều khiển S3, hãy truy cập [Bảng điều khiển Amazon S3] (https://s3.console.aws.amazon.com/) và tải dữ liệu của bạn lên thùng mà bạn đã tạo trong bước trước.
### Chạy phân tích
Khi bạn đã tải lên dữ liệu của mình, bạn có thể chạy một phân tích.Để làm điều này, bạn sẽ cần tạo một tệp cấu hình phân tích.Tệp này sẽ chỉ định loại phân tích mà bạn muốn chạy và các tham số cho phân tích.Bạn có thể tìm thêm thông tin về các tệp cấu hình phân tích trong [tài liệu Amazon OMIC] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/analysis-configuration-files.html).
Khi bạn đã tạo một tệp cấu hình phân tích, bạn có thể chạy phân tích bằng cách sử dụng Amazon OMIC CLI.Để thực hiện việc này, hãy chạy lệnh sau:
`` `
OMIC RUN--Config <Path-to-Phân tích-Configuration-File>
`` `
Amazon OMIC CLI sẽ chạy phân tích và đưa ra kết quả vào bảng điều khiển.
### Trực quan hóa kết quả
Kết quả phân tích của bạn có thể được hiển thị bằng giao diện web Amazon OMIC.Để làm điều này, hãy truy cập [Giao diện web Amazon OMIC] (https://omics.console.aws.amazon.com/) và nhấp vào tab ** **.Nhấp vào tên của dự án của bạn và sau đó nhấp vào tab ** Phân tích **.Bạn sẽ thấy một danh sách tất cả các phân tích đã được chạy trong dự án của bạn.Nhấp vào tên của phân tích mà bạn muốn trực quan hóa và sau đó nhấp vào tab ** trực quan hóa **.Bạn sẽ thấy một danh sách tất cả các trực quan đã được tạo ra để phân tích.Nhấp vào tên của trực quan mà bạn muốn xem.
### Phần kết luận
Hướng dẫn này đã cung cấp cho bạn một hướng dẫn từng bước để sử dụng Amazon OMIC để thực hiện phân tích bộ gen cơ bản.Để biết thêm thông tin, vui lòng tham khảo [tài liệu Amazon OMIC] (https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/).
### hashtags
* #Genomics
* #điện toán đám mây
* #aws
* #Bioinformatics
* #khoa học dữ liệu
[ENGLISH]:
## Amazon Omic Tutorial: A Step-by-Step Guide
Amazon Omic is a cloud-based platform that provides a suite of tools for genomic analysis. It offers a variety of features, including data storage, processing, analysis, and visualization. This tutorial will walk you through the process of using Amazon Omic to perform a basic genomic analysis.
### Prerequisites
To follow this tutorial, you will need the following:
* A basic understanding of genomics
* A subscription to Amazon Web Services (AWS)
* The Amazon Omic CLI
* The [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/)
### Getting Started
The first step is to create a new Amazon Omic project. To do this, log in to the AWS Management Console and go to the **Services** menu. Click on **Genomics** and then click on **Projects**. Click **Create Project** and enter a name for your project.
### Uploading Data
The next step is to upload your genomic data to Amazon Omic. You can do this by using the Amazon Omic CLI or the Amazon S3 console. To use the CLI, run the following command:
```
omic upload --bucket <bucket-name> --path <path-to-data>
```
Where `<bucket-name>` is the name of the bucket where you want to store your data and `<path-to-data>` is the path to the data on your local computer.
To use the S3 console, go to the [Amazon S3 console](https://s3.console.aws.amazon.com/) and upload your data to the bucket that you created in the previous step.
### Running an Analysis
Once you have uploaded your data, you can run an analysis. To do this, you will need to create an analysis configuration file. This file will specify the type of analysis that you want to run and the parameters for the analysis. You can find more information about analysis configuration files in the [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/analysis-configuration-files.html).
Once you have created an analysis configuration file, you can run the analysis by using the Amazon Omic CLI. To do this, run the following command:
```
omic run --config <path-to-analysis-configuration-file>
```
The Amazon Omic CLI will run the analysis and output the results to the console.
### Visualizing the Results
The results of your analysis can be visualized using the Amazon Omic web interface. To do this, go to the [Amazon Omic web interface](https://omics.console.aws.amazon.com/) and click on the **Projects** tab. Click on the name of your project and then click on the **Analysis** tab. You will see a list of all of the analyses that have been run in your project. Click on the name of the analysis that you want to visualize and then click on the **Visualizations** tab. You will see a list of all of the visualizations that have been created for the analysis. Click on the name of the visualization that you want to view.
### Conclusion
This tutorial has provided you with a step-by-step guide to using Amazon Omic to perform a basic genomic analysis. For more information, please refer to the [Amazon Omic documentation](https://docs.aws.amazon.com/genomics/latest/userguide/).
### Hashtags
* #Genomics
* #cloud-computing
* #aws
* #Bioinformatics
* #data-science
